5 software di cariotipizzazione automatizzati per mappare i tuoi cromosomi

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Il cariotipo è il processo di ordinamento e accoppiamento di tutti i cromosomi trovati in un organismo al fine di ottenere una visione omnicomprensiva dell'intera mappa dei cromosomi di un individuo.

Ma prima assicuriamoci di capire quali sono i cromosomi in primo luogo. I cromosomi sono strutture che sembrano simili ai fili contenuti nel nucleo di ciascuna delle cellule del tuo corpo.

Ogni struttura cromosomica contiene l'intero piano di informazioni genetiche del tuo corpo. Questo determina il modo in cui il tuo corpo è strutturato, reagisce agli stimoli, alla predisposizione alle malattie, ecc. Le donne hanno 2 cromosomi "X" e gli uomini hanno un cromosoma "X" e uno "Y". Ogni cellula del tuo corpo contiene 23 paia di cromosomi, 46 cromosomi in totale.

Per consentire ai ricercatori di comprendere le sequenze dei cromosomi di ciascun paziente, usano il software di cariotipizzazione . Questo tipo di software è progettato per eseguire analisi cromosomiche e valuta la struttura e il numero di cromosomi di una persona. In questo modo, ricercatori e scienziati possono rilevare anomalie.

In questo articolo, esploreremo alcune grandi opzioni software che ti permetteranno di eseguire l'analisi del cariotipo.

I 5 strumenti di carotipia automatizzati da utilizzare nel 2019

1

ArgusSoft

ArgusSoft è una grande opzione software che ti permette di cariotipizzare automaticamente i cromosomi umani per posizione di banda e può anche essere usato per il cariotipo di animali e per i cromosomi di piante online.

Caratteristiche principali:

  • Colorazione G, Q, R
  • Karyotyping automatizzato di cromosomi umani con riconoscimento di curve
  • Cariotipizzazione automatizzata dei cromosomi suini
  • 3 basi integrate di ideogrammi standard di cromosomi umani con vari livelli di trasparenza - 400, 550 e 850 livelli
  • Può aggiungere basi di ideogrammi cromosomici standard per altre specie animali e vegetali
  • Metodi di preparazione del campione
  • Immissione di immagini di lastre metafase utilizzando una fotocamera e uno scanner
  • Accompagnando un'immagine con la grafica
  • Divisione automatizzata dei cromosomi applicati e in contatto
  • Confronto di cromosomi e ideogrammi

È inoltre possibile utilizzare ArgusSoft per addestrare il sistema di riconoscimento dei cromosomi mediante preparazioni prestabilite, trasferire immagini di piastre metafase e cariogrammi nel database integrato, produrre schemi di report, correggere i carogrammi e anche memorizzare e stampare immagini e risultati di analisi.

È possibile ottenere formazione e supporto per l'utilizzo di ArgusSoft dal proprio sito Web ufficiale. Il centro di supporto include servizi di formazione, manutenzione e consulenza.

Prova ArgusSoft

2

HiBand di Applied Spectral Imaging

HiBand è un software creato da Applied Spectral Imaging, in grado di eseguire analisi cromosomiche avanzate utilizzando le funzioni di cariotipo digitale. Questo software

utilizza funzioni di scansione automatizzate per un'analisi approfondita della struttura cromosomica.

È possibile utilizzare l'ampia gamma di funzionalità disponibili in HiBand per l'indicizzazione, il conteggio, la memorizzazione e la gestione dei dati dei risultati. Puoi anche usare questo potente software per scansionare automaticamente la sequenza cromosomica.

I risultati ottenuti utilizzando le funzionalità del cariotipo trovate HiBand possono essere memorizzati in un luogo sicuro con livelli protetti da password e crittografati. Ciò ti consente di perdere dati importanti sul sequenziamento e, grazie a ciò, migliora anche l'efficienza del tuo laboratorio.

L'ordinamento dei risultati avviene in modo molto semplice, è sufficiente cercare la sequenza specifica dei cromosomi e tutti i risultati vengono visualizzati in una schermata ben organizzata che offre un facile accesso per modificare, rivedere e anche aggiungere tag a qualsiasi dei file.

Caratteristiche principali:

  • Brightfield Karyotyping-G-Band e R-Band
  • Karotyping-Q-Band di fluorescenza, banda R e FISH
  • Karyotyping spettrale
  • Conteggio automatico dei cromosomi
  • Indicizzazione e classificazione dei cromosomi
  • Separazione avanzata dei cromosomi e miglioramento avanzato dell'immagine
  • Galleria di immagini - può presentare tutte le metafasi del caso e i cariotipi su un'unica schermata
  • Può confrontare i cromosomi: vederli fianco a fianco
  • Ideogramma dell'abberante: puoi aggiungere cromosomi, celle, ideogrammi e annotazioni in un generatore di immagini

HiBand utilizza flussi di lavoro completamente automatizzati per aumentare l'efficienza del laboratorio, dispone di funzionalità di scansione "start-and-walk-away", trova metafasi, legge automaticamente i codici a barre, carica le immagini in tempo reale durante la scansione delle diapositive e le esporta nel LIS Central Portal del laboratorio e Banca dati.

Prova HiBand

3

Ikaros di MetaSystems

Questo sistema di cariotipo ha un'interfaccia utente molto intuitiva che offre tutte le funzionalità su uno schermo. Ciò consente un accesso facile e veloce a tutte le informazioni ottenute.

Ikaros può essere utilizzato con Neon, che è una piattaforma progettata per aiutare con i dati di immagine e l'organizzazione dei casi. Neon raccoglie dati da tutti i lavori di imaging, fonti esterne e consente di presentarli in un modo facile da capire utilizzando un dashboard di gestione dei casi.

Questo strumento consente di avere sempre informazioni importanti a portata di mano e archiviate in modo sicuro, ma utilizza algoritmi di gestione dei dati molto forti, ha una buona gamma di modi per osservare i dati e può fornire ricerche specifiche basate su parole chiave e caratteristiche dei dati.

Scopri maggiori informazioni su Neon e le sue caratteristiche qui .

Ikaros supporta molte diverse tecniche di banding: Brightfield G-Band e R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band e FISH -, offre un gran numero di forme del carogramma pre-definite per esseri umani, piante e animali. Puoi facilmente modificare questi moduli per aggiungere tutti i dati richiesti per il tipo di ricerca che stai facendo.

Il fatto che puoi confrontare i cromosomi per classe o per cariogramma, ti offre informazioni estremamente utili che ti permettono di identificare facilmente le differenze.

Prova Ikaros

4

MetaClass di Microptic

MetaClass è un grande software per il cariotipo progettato in modo modulare. Questo software ti aiuta a eseguire karyotyping e studi FISH sui cromosomi.

MetaClass è formato dai seguenti moduli:

  • Database MetaClass

Database che può essere installato con uno qualsiasi dei moduli di MetaClass. Consente di memorizzare i dati del paziente e offre un facile accesso ai risultati. È possibile creare report personalizzati in qualsiasi lingua con questo modulo.

  • Cariotipo di MetaClass

Ti permette di studiare un cariotipo dopo che le immagini della fase di preparazione alla metafase sono state digitalizzate e disposte in coppie in base alla dimensione, posizione, ecc. Questo modulo ti dà risultati di qualità eccellente quando si tratta di bande cromosomiche, e può anche fornirti rapporti dall'aspetto professionale.

Le caratteristiche principali includono:

  • Lo studio del cariotipo viene analizzato sotto ingrandimento 100X in campo chiaro
  • Può catturare diverse immagini metafase
  • La qualità dell'immagine è modificabile per risultati più nitidi
  • Classificazione automatica dei cromosomi
  • 4 visualizzazioni dello schermo: finestra dei cromosomi di metafase, cariotipo e non classificato
  • Può visualizzare prototipi di cromosomi
  • I cromosomi che non sono classificati possono essere corretti automaticamente o manualmente: sovrapposizioni, separazioni, incroci, rotazioni, ecc.
  • I file di sessione MTC o le immagini BMP possono essere salvati e ricaricati in qualsiasi momento
  • Può esportare singoli cromosomi nel database Metaclass con la possibilità di aggiungere commenti e note

Ecco un esempio di un report di karyotyping Metaclass.

  • MetaClass FISH

Questo è un modulo di analisi che consente di ottenere l'immagine di ibridazione IN SITU fluorescente (FISH). Questo modulo acquisisce immagini usando sonde fluorescenti del DNA e consente di confermare anomalie genetiche - trisomie, mocrodelections, riarrangiamenti cromosomici, ecc.

Le immagini FISH sono analizzate con ingrandimento 100X e, per una gamma più ampia di chiarezza dell'immagine, possono anche catturare immagini con filtri diversi.

Se sei interessato a scoprire maggiori informazioni sui moduli presentati sopra e altre caratteristiche, puoi dare un'occhiata al catalogo di MetaClass.

Se sei un tipo curioso e vuoi vedere un rapporto ottenuto usando il metodo FISH, puoi farlo

un file PDF di esempio.

Prova MetaClass

5

GenASis Bandview

GenASis Bandview è un altro grande software di cariotipo costruito con moduli con diversi capabitiliti. È possibile utilizzare questa app per eseguire la diagnostica del cariotipo e ottenere risultati accurati dei test.

Questo software ti consente di personalizzare completamente il flusso di lavoro e il processo di diagnosi, in base alle esigenze della tua azienda e agli obiettivi che stai cercando di raggiungere.

La vasta gamma di strumenti forniti in BandView è facilmente accessibile con un solo clic del mouse e offre un'esperienza di carotaggio G / R / C / Q-Band potente. È possibile scegliere tra un flusso di lavoro automatico o manuale quando si tratta di localizzare metafasi e acquisire immagini.

Anomalie cromosomiche, se trovate, possono essere osservate attraverso l'aggiunta, la cancellazione o il riarrangiamento del materiale genetico del paziente. Con BandView, puoi usare la banda della tecnica molecolare FISH.

FISH utilizza sonde fluorescenti per attaccare a diverse parti del cromosoma, consentendo al software di rilevare e localizzare le anomalie presenti in specifiche sequenze di DNA.

Prova GenASis Bandview

Conclusione

In questo articolo, abbiamo esplorato alcuni dei migliori software di carotipia automatizzati esistenti sul mercato alla fine del 2018.

Le opzioni del software di cariotipo illustrate in questo articolo offrono una varietà di funzioni che ti aiuteranno a raggiungere gli obiettivi della tua azienda.

Utilizzando questo tipo di software, puoi contare rapidamente migliaia di strutture cromosomiche, analizzare con diverse tecniche professionali e produrre report di alta qualità che ti permetteranno di identificare facilmente eventuali anomalie.

Ci piacerebbe scoprire qual è la tua opinione riguardo al software che abbiamo presentato in questa top 5. Non esitate a farcelo sapere utilizzando la sezione commenti qui sotto.

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